Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
BRD3Q15059 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms