Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms