Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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ATP1A4Q13733 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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ATP1A4Q13733 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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