Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTCH1Q13635 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms