Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms