Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
AP3B2Q13367 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms