Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FAM3AP98173 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms