Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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