Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AC013470.2-202ENST00000635746 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CEP290O15078 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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CEP290O15078 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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CEP290O15078 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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CEP290O15078 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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CEP290O15078 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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CEP290O15078 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CEP290O15078 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CEP290O15078 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CEP290O15078 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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