Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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SALL4Q9UJQ4 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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SALL4Q9UJQ4 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 LINC01762-205ENST00000437308 539 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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SALL4Q9UJQ4 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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SALL4Q9UJQ4 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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SALL4Q9UJQ4 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SALL4Q9UJQ4 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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