Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC142Q17RM4 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
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