Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
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GRIK4Q16099 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
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GRIK4Q16099 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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GRIK4Q16099 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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GRIK4Q16099 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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GRIK4Q16099 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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GRIK4Q16099 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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GRIK4Q16099 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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GRIK4Q16099 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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GRIK4Q16099 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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