Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC01364-201ENST00000452509 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMCO1Q147U7 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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