Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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