Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
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