Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ITGB3BPQ13352 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms