Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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