Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 LINC02102-201ENST00000503989 3364 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 HNRNPU-216ENST00000638716 2640 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 ZKSCAN5-201ENST00000326775 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 MTF1-201ENST00000373036 7972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 GOLGA8B-202ENST00000438958 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 CNGA2-201ENST00000329903 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 RNVU1-15-201ENST00000384476 165 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC127537.1-201ENST00000418183 748 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC087385.2-201ENST00000477729 498 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 IGKV1D-16-201ENST00000492446 378 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 OR7E87P-201ENST00000532397 929 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 DNM1P33-201ENST00000565222 270 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC006335.3-201ENST00000613408 292 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AP005242.3-201ENST00000623604 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 POLR3B-202ENST00000539066 4118 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 EFNA5-201ENST00000333274 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 STARD5-201ENST00000302824 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 TNS4-201ENST00000254051 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 ZNF385D-201ENST00000281523 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 BTF3L4-202ENST00000472944 2159 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 MRPL22-201ENST00000265229 3035 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AL450124.1-201ENST00000376401 353 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 SNORA7B-201ENST00000384360 139 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC092570.2-201ENST00000452117 1143 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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