Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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