Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 ZNF566-204ENST00000434377 5197 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 FAM186A-204ENST00000543111 8200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 ATP2B4-203ENST00000357681 8968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 MR1-208ENST00000614012 7860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 GRIP1-201ENST00000359742 5216 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 MR1-205ENST00000434571 7479 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CENPFP49454 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CENPFP49454 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
CENPFP49454 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
CENPFP49454 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
CENPFP49454 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
CENPFP49454 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
CENPFP49454 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CENPFP49454 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 DROSHA-201ENST00000344624 5102 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms