Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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USP18Q9UMW8 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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USP18Q9UMW8 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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USP18Q9UMW8 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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USP18Q9UMW8 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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USP18Q9UMW8 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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USP18Q9UMW8 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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USP18Q9UMW8 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
USP18Q9UMW8 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
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