Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AL772337.3-201ENST00000447524 452 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC009153.1-201ENST00000485799 496 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 LINC01989-201ENST00000566930 1081 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 U47924.1-201ENST00000606539 434 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 PRLR-213ENST00000514088 1440 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 WASF5P-205ENST00000428639 1455 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 ADAMTS9-AS2-202ENST00000474768 2388 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 OR2T10-201ENST00000330500 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 SNX18P14-201ENST00000429308 574 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC114488.2-222ENST00000445166 362 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 LINC01182-201ENST00000503532 582 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 IGHV1OR15-3-201ENST00000564926 351 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCG3Q8WXD2 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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