Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1AQ15573 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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