Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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RAB39AQ14964 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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RAB39AQ14964 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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RAB39AQ14964 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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RAB39AQ14964 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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RAB39AQ14964 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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