Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms