Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 EIF4A1P10-201ENST00000428832 1216 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC019080.2-201ENST00000453859 394 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC007547.2-201ENST00000468802 360 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL445187.1-201ENST00000502685 260 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC079768.1-201ENST00000503181 711 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AAMDC-203ENST00000525034 511 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 OR7E96P-201ENST00000530816 976 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC073571.1-201ENST00000549103 475 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC092757.2-201ENST00000559026 633 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC022558.2-201ENST00000566841 754 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC005387.1-201ENST00000597837 352 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 PTPRT-211ENST00000618610 3230 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 C2CD5-218ENST00000545552 3471 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TMCC1-AS1-204ENST00000605830 3496 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 GPM6B-201ENST00000316715 3275 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MR1-208ENST00000614012 7860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC016251.1-201ENST00000624299 4198 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LINC02128-205ENST00000641755 1334 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RBBP5-201ENST00000264515 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CDK15-202ENST00000410091 1780 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 IKZF5-201ENST00000368886 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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CLN3Q13286 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 NPFFR2-204ENST00000395999 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ZNF512-201ENST00000355467 3541 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TMC1-202ENST00000340019 3068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC006141.1-201ENST00000581917 2170 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MMP20-201ENST00000260228 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 GSTO2-202ENST00000369707 6423 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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CLN3Q13286 PDE4D-208ENST00000502484 2478 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC135012.3-201ENST00000599841 4039 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 EPB41L1-201ENST00000202028 3514 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 SNORA10B-201ENST00000384458 133 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL109924.2-201ENST00000419800 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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