Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD12P35452 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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HOXD12P35452 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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HOXD12P35452 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD12P35452 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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