Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
POLR2AP24928 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms