Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 CREM-208ENST00000361599 2170 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPRAP18433 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms