Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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