Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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