Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GDAP2Q9NXN4 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GDAP2Q9NXN4 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms