Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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COL24A1Q17RW2 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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COL24A1Q17RW2 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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COL24A1Q17RW2 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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COL24A1Q17RW2 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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COL24A1Q17RW2 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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COL24A1Q17RW2 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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COL24A1Q17RW2 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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