Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDK4Q16654 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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