Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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VPS72Q15906 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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VPS72Q15906 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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VPS72Q15906 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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