Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 TFG-204ENST00000476228 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SMR3A-201ENST00000226460 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 IFNA12P-201ENST00000413147 571 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL357552.2-201ENST00000433876 353 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 BSNDP4-201ENST00000436076 388 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AP001469.2-201ENST00000444966 390 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC123768.1-202ENST00000460684 461 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 TAAR3P-202ENST00000481759 1025 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LINC00967-204ENST00000518412 271 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AP003721.1-201ENST00000543907 864 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL355102.4-201ENST00000553638 738 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC022405.1-201ENST00000559841 516 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC009021.1-201ENST00000566098 375 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ZNF286A-214ENST00000581529 560 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PART1_3.1-201ENST00000619680 131 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC087893.2-201ENST00000623272 255 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 AC090114.1-201ENST00000393266 448 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAMP3Q15836 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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