Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 UNC50-203ENST00000409347 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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