Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CU638689.4-205ENST00000623313 596 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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FOXE3Q13461 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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FOXE3Q13461 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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