Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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ITGB3BPQ13352 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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ITGB3BPQ13352 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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ITGB3BPQ13352 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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ITGB3BPQ13352 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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ITGB3BPQ13352 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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ITGB3BPQ13352 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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ITGB3BPQ13352 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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ITGB3BPQ13352 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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ITGB3BPQ13352 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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