Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RN7SL74P-201ENST00000464966 299 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 RPL34P22-201ENST00000468193 318 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC006070.1-201ENST00000508151 193 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
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MKRN3Q13064 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
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MKRN3Q13064 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC129492.5-201ENST00000603489 315 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
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MKRN3Q13064 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL132796.3-201ENST00000624703 900 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
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MKRN3Q13064 AL138924.1-201ENST00000629067 415 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
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MKRN3Q13064 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 TENM2-203ENST00000518659 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 LIN9-205ENST00000481685 1916 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC092999.1-201ENST00000624004 1924 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 SYNPR-204ENST00000460711 2383 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AC022150.4-201ENST00000598322 2848 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 WISP3-202ENST00000361714 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 BDNF-204ENST00000395980 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL845331.3-201ENST00000562821 2028 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AL354993.1-201ENST00000436286 3280 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 PRRG1-201ENST00000378628 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
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MKRN3Q13064 RETREG1-202ENST00000399793 3145 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 PTPRM-202ENST00000400053 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
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MKRN3Q13064 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 AP005242.3-201ENST00000623604 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 SLC8A1-AS1-228ENST00000627210 225 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 LINC01206-228ENST00000628718 871 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 CNTNAP4-202ENST00000377504 4723 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 ZNF430-201ENST00000261560 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 SLFN13-204ENST00000526861 6004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
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MKRN3Q13064 PECAM1-203ENST00000563924 6831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
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MKRN3Q13064 LRRC4C-204ENST00000530763 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 FAM111A-202ENST00000420244 3780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 ZMAT4-201ENST00000297737 2466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 RSPO2-203ENST00000517939 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 CPM-201ENST00000338356 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 MCM3-205ENST00000596288 3169 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
MKRN3Q13064 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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