Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 MRPL45P2-203ENST00000573318 473 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IFFO1Q0D2I5 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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