Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
EPHB4P54760 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms