Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms