Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 NEK1-207ENST00000511633 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 PIEZO2-201ENST00000302079 9356 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 DNAH10-201ENST00000409039 14473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 EIF4E3-204ENST00000425534 9949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 PPIP5K1-201ENST00000334933 5586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 PKD1L3-201ENST00000620267 5199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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PKHD1P08F94 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 VCL-202ENST00000372755 6489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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PKHD1P08F94 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 TNFSF15-202ENST00000374045 6687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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PKHD1P08F94 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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PKHD1P08F94 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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PKHD1P08F94 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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PKHD1P08F94 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MYO5A-202ENST00000358212 12220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MYO5A-206ENST00000399233 12220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MYOCD-203ENST00000425538 8466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AC245060.6-201ENST00000624350 8420 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 ST8SIA3-201ENST00000324000 11833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKHD1P08F94 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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