Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP290O15078 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP290O15078 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP290O15078 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP290O15078 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP290O15078 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP290O15078 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP290O15078 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP290O15078 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP290O15078 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP290O15078 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP290O15078 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP290O15078 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP290O15078 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP290O15078 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP290O15078 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP290O15078 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP290O15078 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP290O15078 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP290O15078 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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CEP290O15078 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CEP290O15078 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CEP290O15078 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CEP290O15078 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CEP290O15078 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CEP290O15078 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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CEP290O15078 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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CEP290O15078 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
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CEP290O15078 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CEP290O15078 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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CEP290O15078 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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CEP290O15078 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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CEP290O15078 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CEP290O15078 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CEP290O15078 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CEP290O15078 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CEP290O15078 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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