Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ERVV-1B6SEH8 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms