Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms