Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SEMA3CQ99985 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms