Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AL513303.1-201ENST00000432452 591 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
UBXN4Q92575 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms