Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRIG3Q6UXM1 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms